Такие ошибки допускаются в основном в проектах по реструктуризации или реорганизации предприятия (группы предприятий), а также в планах организации производства нового товара в многоптоварных организациях. Самой большой ошибкой таких проектов является применение способа чистых оценок эффективности деятельности предприятия вместо приростного или сопоставительного метода. В ходе такого проекта совершается подмена итога осуществления проекта планируемым совокупным результатом функционирования предприятия:

• в проектах реструктуризации и реорганизации оценка итога осуществления проекта (увеличение прибыли или экономию на затратах в следствии внедрения проектных мероприятий)достаточно сложна, поэтому разработчики в составе поступлений по проекту обозначают выручку, запланированную предприятием, а не действительный экономический эффект;
• наиболее распространенной ошибкой в проектах организации производства нового продукта является рассмотрение в качестве прибыли по планированию не выручки от осуществления продаж данного определенного продукта, а валовой выручки организации. В этом случае в роли инвестиционных затрат в расчетах рассматриваются только затраты, основывающиеся на производство продукта, по плану проекта. Это отличие завышает показатели эффективности осуществления проекта.